Какие инструменты для Linked Data использовать в 2020 году

Protege

Удобный ручной ввод OWL.

Apache Jena

База данных хранящая триплеты.

Документация

fuseki2

Расширение Jena, веб сервер по SPARQL запросам.

Документация

Docker

Позволяет держать Jena DB на отдельном инстансе.

Документация